Bazı protistler hücre duvarlarına sahiptir, ancak diğerleri yoktur. Hücre duvarlarına sahip protistler, mantar benzeri Oomikota ile birlikte fotosentetik diatomlar, kırmızı algler ve yeşil algler içerir. Kahverengi algler ve hayvan benzeri protistler gibi diğer protistlerin çoğu yok.
Farklı protist gruplarının, farklı malzemelerden oluşan hücre duvarları vardır. Yeşil algler ve Oomycota, bitki hücrelerinin etrafındakiler gibi, en azından kısmen selülozdan yapılmış hücre duvarlarına sahiptir. Kırmızı algler ayrıca hücre duvarlarında selüloza sahiptir, fakat duvarlarda kalsiyum karbonat da bulunur. İki atomlu dünyanın ana bileşeni olan dialarda silikadan yapılmış hücre duvarları bulunur.
