Enzimler, moleküllerin birbirine bağlanması veya aktif bölge denilen parçalanması için bir yer oluşturarak çalışır. Bir molekül aktif bölgeye girdiğinde, kimyasal bir reaksiyon gerçekleşir. Kimyasal reaksiyonun meydana gelme hızı, enzimin etkisiyle belirlenir. Vücudun farklı bölgelerinde farklı enzimler bulunur ve her enzim sadece bir molekül tipi üzerinde çalışır.
Enzim fonksiyonu, inhibitörler ve aktivatörler tarafından kontrol edilir. İnhibitörler enzimi yavaşlatır veya reaksiyonu durdurur. Enzimin şeklini değiştirir, böylece ya bir molekülü kabul etmez ya da onu daha yavaş kabul eder. Aktivatörler inhibitörlerin zıddıdır. Enzimlerin aktivitesini hızlandırırlar. Hormonlar sıklıkla enzimleri aktive etmek için kullanılır.
Enzimler, sıcaklık ve ortamın asitliği ile değiştirilebilir. Her enzim en iyi sıcaklık aralığında çalışır. Bu aralığın dışındaki sıcaklıklar, enzimin şeklini değiştirerek artık kullanılamayacak şekilde değişebilir. Her bir enzim, pH seviyesi adı verilen ideal bir asitlik seviyesinde de çalışır. Bir enzim yanlış pH seviyesine sahip bir ortama yerleştirilirse, enzim şekli değişir ve artık işlev göremez.