Sıcaklık, pH seviyesi ve enzim ve substrat konsantrasyonları, enzim işlevselliğini etkiler. Kimyasal inhibitörler, enzimlerin nasıl işlediğini ve etkililiğini de azaltabilir.
Sıcaklık, verilen herhangi bir molekülün kinetik enerjisini etkiler. Sıcak sıcaklıklar daha fazla kinetik enerji sağlar ve başarılı moleküler çarpışma şansını arttırır. En uygun sıcaklığın üstünde, moleküler bağlar kırıldıkça ve katalitik aktivite potansiyeli azaldıkça enzim yapısı bozulmaya başlar.
Sıcaklık gibi, enzim işlevselliği için de optimum bir pH seviyesi vardır. PH seviyelerindeki değişiklikler, moleküler bağları oluşturabilir veya bozabilir, enzimlerin şeklini değiştirebilir ve enzimin etkinliğini doğrudan etkileyebilir.
Enzimler tarafından katalizlenen reaksiyonların oranı, enzim ve substrat konsantrasyonlarına bağlıdır. Tepkime hızı, her ikisinin de konsantrasyonu arttıkça artar. Artış oranı, aktif bölge substrat ile doyuncaya kadar büyür. Substrat konsantrasyonu yüksekse ve sıcaklık ve pH tutarlı bir seviyede tutulursa, reaksiyon hızı doğrudan enzim konsantrasyonuyla orantılıdır.
İnhibitörler olarak adlandırılan kimyasallar enzimin katalitik aktivitesini azaltabilir veya hatta durdurabilir. Aktif bölgeye yönelik inhibitörler, aktif bölgeyi işgal eder ve aktif bölge için substrat ile rekabet eder. Aktif olmayan bölgeye yönelik inhibitörler olarak adlandırılan diğer inhibitörler, enzim yapısına yapışır ve şeklini bozar.
