Endokrin sistemin boşaltım sistemini etkilemesinin ana yolu idrarla salınan su miktarını kontrol etmektir. Endokrin sistemi böbreklerin idrardan su emmesi için bir dizi hormon salgılar kan su seviyesi düşük.
Hipotalamus kandaki elektrolit seviyelerini izler. Artan bir elektrolit konsantrasyonu dehidrasyona işaret ederken, düşük bir konsantrasyon aşırı hidrasyona işaret edebilir. Su kaybının en yaygın nedenleri yetersiz su alımı, aşırı terleme ve kan kaybıdır. Hipotalamus vücudun susuz kaldığını tespit ettiğinde, daha sonra hipofiz bezine aktarılan ve bırakılan antidiüretik hormon üretir.
Antidiüretik hormon böbreklere yayılır ve burada su alma oranını arttırır. Bunu böbreklerin böbreklerden süzülen tübüllerde su kanalları oluşturmasına neden olarak yapar. Kan dolaşımına geri akan su, kanallar tekrar kapanana kadar antidiüretik hormonun azalmasına neden olur.
Böbreklerin su emme yolunu düzenleyen başka bir hormon, böbreküstü bezleri tarafından üretilen aldosterondur. Aldosteron, suyun böbrekler tarafından nasıl emildiğini etkilemek için vücudun çözünmüş kimyasallarla çalışma şeklini değiştirir.