Farklı eklembacaklılar farklı solunum sistemlerine sahiptir. Bazılarında gaz değişiminin gerçekleştiği solungaçlar, diğerlerinde ise trakeal solunum sistemi vardır. Her solunum sistemi biraz farklı çalışır.
Sadece suda yaşayan eklembacaklıların solungaçları vardır. Bu hayvanların solungaçları, balıkların solungaçlarıyla aynı şekilde çalışır ve hayvanların oksijen almalarını sağlayan gaz değişimi sağlar.
Kara eklembacaklılar, hayvanın tüm vücuduna yerleştirilmiş küçük hava kanalları olan trakea sistemine sahiptir. Eklembacaklılar bu hava kanallarını açıp kapama yeteneğine sahiptir, böylece gerektiğinde suyu koruyabilirler.