Bir hücrenin çekirdeği, DNA'dan ve nükleol'den yapılan kromozomlar içerir. Hücre çekirdeği, hücrenin geri kalanında önemli proteinlerin üretimini de düzenler. Hem kromozomlar hem de nükleolus olmadan, çoğu hücre tipi hayatta kalamaz.
Kromozomlar, çekirdekteki DNA'dan yapıldığı için en önemli yapıdır. DNA, hücreye nasıl büyüyeceğini, çoğalacağını ve gelişeceğini söyleyen tüm talimatları içerir. DNA zarar görürse, hücre düzgün çalışamaz.
Nükleol, uygun hücre fonksiyonu için de hayati öneme sahiptir. Çekirdeğin içinde bulunur ve çeşitli proteinlerden ve RNA'dan yapılır. Nükleolusun işlevi, birçok hücre işlevi için gerekli olan proteinleri üreten, ribozom adı verilen özel bir ürün tipi oluşturmaktır.
Çekirdeğin önemli bir rolü, hücrenin protein üretimini kontrol etmektir. Bunu, hücre boyunca belirli proteinleri oluşturmak için bir şablon olan haberci RNA'yı göndererek yapar. Messenger RNA başlangıçta çekirdekte bulunur, ancak protein üretimi gerektiğinde sitoplazmaya gönderilir. Protein üretimini düzenleyen çekirdek olmadan, hücre hayatta kalmak için doğru proteinleri üretmez.