Birçok botanikçi büyüteçler, kameralar, GPS cihazları, alan kılavuzları ve bilgisayarlar gibi araçlar kullanır. Ek olarak, basit bir defter ve kalem, saha biyologlarının gözlemlerini kaydetmelerini sağlayan paha biçilmez bir araçtır. Botanikçiler uzmanlık alanlarına ve başarmaya çalıştıkları özel göreve bağlı olarak çeşitli farklı araçlar kullanırlar.
Bazı botanikçiler, laboratuarlarda çok gelişmiş alet ve ekipmanlar ile çalışırlar. Örneğin, bir bitkinin DNA'sını veya mikroskobik yapısını araştırmaya çalışan botanikçiler için mikroskoplar ve diğer yüksek teknoloji ürünü laboratuar ekipmanları gerekebilir. Diğer botanikçiler seralarda çalışarak bitkilerin büyüme alışkanlıklarını ve besin gereksinimlerini inceliyorlar. Bu tür bilim adamları, higrometreler, toprak test kitleri ve diğer ölçüm cihazları kullanmalıdır. Akademik yönelimli botanikçiler, özellikle taksonomi veya sistematik okumaya odaklananlar, zamanlarının çoğunu işlerini tamamlamak için bilgisayarları ve danışmanlık kitaplarını kullanarak geçirirler.
Budayıcılar, makaslar ve fıskiyeler, özellikle sahada çalışanlar arasında, çeşitli uzmanlıklara sahip botanikçiler tarafından kullanılır. Bazı botanikçiler, küçük otsu bitkilerin köklerini kazmak için hori-hori adı verilen bir alet kullanırlar. Konteynırlar ve toplama torbaları, daha ayrıntılı analiz için numuneleri laboratuara geri taşımak için faydalıdır. Bitki presleri aynı zamanda botanikçilerin gelecekteki çalışmalar için yaprakları korumalarını sağlayan yararlı araçlardır.
