Genellikle bakteri hücrelerinin organelleri vardır, ancak bunlar genellikle sayıca azdır ve bitkilerde ve hayvanlarda bulunanlardan daha az karmaşıktır. Bu organeller, sitoplazmanın içinde yer alan ve RNA açısından zengin granüllerden oluşur ve protein sentezi için olan yerlerdir.
Bakteri hücreleri, bitki ve hayvanlardan farklı olarak oluşur. Ribozomlar dışında, bir çekirdek ve çoğu zara bağlı organelden yoksundurlar. Bakteriyel hücre, dönmesine izin veren bazal bir gövdeye sahiptir ve çoğunun, hücre duvarının dışında bir zarı vardır. Bakteriyel hücreler, sitoplazmada bulunan DNA'yı içerir.
Diğer organeller flagellum ve pili içerebilir. Bakterinin flagellum hareketi için kullanılır. Pili bakterilerin DNA transferini ve yüzeylere yapışmasını sağlar.
