Bağışıklık sistemi, patojenlerin vücudun normal çalışmasını engellemesini önleyerek homeostaziyi korur. Bunu, vücudun yeni bir patojenle karşılaştığında adaptif bağışıklık dahil olmak üzere çeşitli şekillerde başarır; cilt ve bakterileri parçalamak için mukus zarlarını kullanma.
Virüsler ve ateşe neden olan, kan basıncını yükselten ve kan pH'ını değiştiren diğer mikroorganizmalar dahil olmak üzere çeşitli faktörler homeostazı bozabilir. Bağışıklık sistemi, bu tür mikroorganizmaların sorunlu hale gelmesini önleyerek ve normal işleyişini bozma kabiliyetlerini azaltarak homeostazı sürdürür. Örneğin, uyarlamalı bağışıklıkta, bağışıklık sistemi vücuda ilk girdiğinde bir patojeni hatırlar. Vücuda ikinci kez girdiğinde, anında ikinci bir enfeksiyona neden olmasını ve homeostazı bozmasını önleyerek, onu çözer.
Bağışıklık sisteminin cildi, antijenleri ve mukus membranları dahil vücudu korumanın birkaç yolu vardır. Deri vücudun ilk savunma hattıdır. Bağışıklık sistemi bazı bakterileri algılayan bir cilt pH'sını destekler. Antijenler yabancı bir maddeyle karşılaştıklarında, onu hatırlar ve daha sonra tekrar kan dolaşımına girdiğinde antikorlar üretir. Solunum yolu, mukus membranlarına ve kirpiklere ev sahipliği yapar. Mukus zarlarında patojenlerle mücadele eden enzimler bulunur ve kirpikler onları uzaklaştırır.
