Virüsler bilimsel olarak organizmalara benzer şekilde adlandırılır; cins ve tür adı ile anılırlar. Bunların üstünde, her birine ek olan iki sınıflandırma sistemi, virüsler için bir taksonomi oluşturur.
Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi, cins ve tür tanımlarından önce aileleri ve alt aileleri içeren yedi düzenden birine virüsleri organize eder. Virüsler, göreceli olarak küçük genomlara ve yüksek mutasyon oranlarına sahip olduklarından, bir düzenin taksonomisinin üzerinde sınıflandırmak zordur. İlk olarak 1971'de tanımlanan Baltimore sınıflandırma sistemi, nükleik asit kombinasyonlarını, ister tek ister çift sarmallı olsunlar, nükleik asidin replikasyon ve polaritesi pozitif veya negatif olmak üzere yedi gruba ayırır .