Ökaryotik hücrelerin hepsinde bir çekirdek bulunur ve organelleri membranların içinde bulunur. Ayrıca, tüm hücreyi saran bir fosfolipit tabakası olan bir plazma membranına da sahiptirler ve bir iç hücre iskeleti içerir .
Prokaryotik hücrelere kıyasla, ökaryotik hücreler en az 10 kat daha büyüktür. Sitoplazmaları, hem ribozomlardan hem de sistolden oluşur. Plazma membranlarıyla korunan ayrıca her organel için ayrı ayrı membranlar şeklinde korumalara sahiptirler. Plazma zarı, tüm hücre için sinyalleşme ve nakil fonksiyonları için alandır.
Ökaryotik hücrelerde, endomembran sistemi, membran paylaşan materyaller ağıdır. Lizozomlar, endoplazmik retikulum ve Golgi aparatları bu daha büyük sistemin bir parçasıdır. Ökaryotik hücreler ayrıca, diğer hücrelerin salgıladıkları glikoproteinlerden ve proteinlerden oluşan hücre dışı bir matrise da sahiptir. Bu matris birçok farklı hayvan hücresinin etrafında oturur.
Ökaryotik hücreler, ökaryotun tipine bağlı olarak, flagella veya cilia'nın işleviyle hareket eder. Flagella hücrenin bir ucunda bulunan ve hücrenin bir yöne ilerleyen uçlarından çıkan kuyruklardır. Kirpikler daha kısa ve sayısızdır ve hücreyi belirli bir yöne yönlendirmek için hepsi bir araya gelirler.
