Rüzgar enerjisinin birçok avantajı vardır ancak aşağıdakiler de dahil olmak üzere bazı dezavantajları vardır: aralıklılık, başlangıç maliyetleri, vahşi yaşam etkisi, gürültü ve görünüm. Bu olumsuzluklar genel olarak teknoloji, maliyet ve çevresel etki olarak sınıflandırılabilir.
Rüzgar enerjisi sadece rüzgar yeterli hızda esiyorsa çalışır. Enerjinin depolanması zordur, bu nedenle tutarlı enerji sağlamak için diğer enerji biçimlerinin rüzgarla birlikte çalışması gerekir. Güneş enerjisine kıyasla rüzgarın bir avantajı, rüzgar gücünün günün zamanına dayanmamasıdır.
Arazi edinme, türbinleri kurma ve başka altyapılar inşa etme maliyeti, diğer bazı enerji türlerine kıyasla daha yüksektir. Türbin teknolojisi geliştikçe, rüzgar santrallerinin kurulması ve işletilmesi maliyetleri, diğer enerji türleriyle rekabet edebilecek bir orana düştü. Yüksek rüzgar alanlarındaki pek çok rüzgar türbinini birlikte gruplayarak verimlilik elde edilir.
Rüzgar türbinleri büyük ve yakınlarda gürültülü, bazıları çirkin görünüyor. Bu konular mevcut rüzgar teknolojisinde doğal olarak yer aldığından, toplum standartlarına uygun ve yerel çevreyi en az etkileyen yerler seçilmelidir.
Son olarak, rüzgar türbinleri vahşi yaşamı öldürür. Çalışmalar, kuşların ve yarasaların risk altında olduğunu, ancak etkinin rüzgar kaynağı alanlarına göre büyük ölçüde değiştiğini göstermiştir. Etkiyi en aza indirmeye çalışmak için dahil olan faktörleri belirlemeye yönelik çalışmalar devam etmektedir.
