Protistler ekosistemde, dünyadaki oksijenin yüzde 70 ila 80'ini üretmek, su hayvanları için ana bir besin kaynağı ve ölü maddelerin önemli bir ayrıştırıcı ajanı olmak gibi çeşitli amaçlara hizmet eder. Pasifik Okyanusu'ndaki varek ormanlarının dev yosun olduğu gibi, 300 metre uzunluğunda.
Protistler, hastalıklardaki rolleri nedeniyle ekosistemde de bir rol oynar. İlişkili oldukları hastalıklardan bazıları sıtma ve uyuma hastalıklarını içerir. Protistler, aynı hastalıklara karşı aşı oluşturmak için de kullanılabilir. Çorba kalınlaştırıcılar, filtreler ve cilalama ürünleri de dahil olmak üzere, protistler için günlük kullanımların daha basitleri vardır.