Prokaryotik organizmalar iki alana ayrılır: ototroflar ve heterotrofler içeren bakteri ve archa. tüm organizmaların yapısı. Prokaryotlar ayrıca kendi alanları içindeki gruplara ayrılır; Her iki grup da heterotroflar ve ototroflar ve çeşitli türler içerir.
Prokaryotlar, ototrofik ve heterotrofik yöntemler olan besinleri nasıl elde ettiklerine bağlı olarak iki gruba ayrılır. Ototrofik prokaryotlar, yiyecekleri kendileri yaparak elde edenlerdir: bu organizmalar öncelikle, güneş ışığını emmeyi ve kullanılabilir enerjiye dönüştürmeyi, besin üretmek için kullanılan fotosentez işlemini kullanır. Bu prokaryotlar ayrıca inorganik kimyasallardan enerji alabilir ve kemosentetik organizmalar olarak adlandırılır. SUNY'a göre siyanobakteriler, gıda üretimi için fotosentezi kullanan prokaryot tipleridir. Bazı prokaryotlar enerji için kendi besinlerini oluştururken, diğerleri besin parçacıklarını ve organik maddeleri alarak besinleri alır. Heterotrofik prokaryotlar adı verilen bu organizmalar öncelikle aerobiktir ve üç ayrı tür içerir. Bu tür heterotroflar şunlardır: saprotrofik, paraziter ve karşılıklıcı organizmalar. Saprotrofik organizmalar ayrıştırıcılar; bu grup en heterotrofları içerir. Parazitler, konakçı türlerden gıdaları genellikle yırtıcı bir şekilde alırken, karşılıklıcı heterotroflar, yiyecek ve su elde etmek ve alışverişinde bulunmak üzere diğer türlerle karşılıklı olarak yararlı ilişkiler kurar.
