Patojenik olmayan bakteri listesi, insanlarda hastalıklara neden olmayan bakteri türlerinin bir özetidir. Staphylococcus, lactobacillus, Escherichia coli, bifidobacteria, bacteroides ve Brevibacterium linens'i içerir. Bu bakteriler vücudun işleyişinde olumlu rol oynar ve bu nedenle zararsızdır.
SFGate'e göre, laktobasil türleri, fermente gıdalarda ve süt gibi diğer yaygın gıda ürünlerinde bulunur. Bunlar ayrıca insan vajinal, bağırsak ve oral mikrofloranın önemli parçalarıdır. En yaygın laktobasil, L. plantarum, L. reuteri ve L. acidophilus'tur. Lactobacillus laktik asit üretebilir ve laktoz kullanabilir. Bu, yoğurt üretimi gibi gıda fermantasyon işlemlerinde önemli kılmaktadır. Escherichia coli, irili ufaklı bağırsaklarda normal floranın bir bölümünü oluşturur. Sindirilmemiş şekerleri parçalayarak sindirime yardımcı olur. Ayrıca hücresel işlemlerde kullanılan biotin ve K vitamini üretir. Bacteroides bağırsaklarda bulunur. Patojenik bakterilerin bağırsakları kolonize etmesini önler, faydalı besinleri parçalar ve önemsiz besinleri tüketir. Staphylococcus epidermis gibi patojenik olmayan Staphylococcus, cilt, ter bezleri ve kulak kanalındaki normal floranın bir parçasını oluşturur. Bifidobacteria normal kolon florasının bir parçasını oluşturur. Probiyotik ürünler üretmek için gıda endüstrisi işlemlerinde kullanılır. Bazı patojenik olmayan bakteri türleri, alerjilerin tedavisi gibi terapötik işlemlerde uygulanır.