Boşaltım olarak da bilinen metabolik atıklar, canlı organizmaların metabolik aktiviteleri tarafından üretilen maddelerdir. Bu maddeler organizma tarafından kullanılamaz ve atılır. Bu atılımlar arasında karbon dioksit, azot bileşikleri, sülfatlar, fosfatlar ve su bulunur.
Hayvanlar, faydalı olmadıkları için metabolik atıkları dışarı atarlar, ancak bitkiler bu atıkların bazılarını faydalı maddelere dönüştürebilir.
Metabolik atıklar böbrekler ve malpighian tübüller gibi boşaltıcı organlardan atılır. İnsan vücudundaki en büyük organ olan cilt aynı zamanda boşaltıcı bir organ görevi görür. Deri, gözeneklerinden terleme geçiren ter bezlerine sahiptir. Terleme tuzlardan, sudan ve azotlu atıklardan oluşur.
Üre, amonyak ve ürik asit organizmalardan elimine edilen üç azotlu atıktır. Bu maddeler protein metabolizmasından üretilir ve oldukça toksiktir. Yüksek toksisitesinden dolayı amonyağı boşaltmak için bol su gerekir. Üre, amonyaktan daha az toksik olduğundan, atılımı için daha az su gerekir. Ürik asit, üre ve amonyağa göre daha az toksiktir ve atılımı için sadece az miktarda su gerekir.Karbon dioksit gibi metabolik atıklar, yoğunlaşma reaksiyonlarında karbonhidrat ve lipitlerin katabolizması sırasında oluşur. Katabolizma, lipitler, protein ve nükleik asitler gibi karmaşık moleküllerin enerji salınımı ile daha küçük birimlere bölündüğü metabolik bir işlemdir. Karbondioksit gece hayvanlar ve bitkilerin atık ürünüdür.