Mantarlar ekosistem için anahtardır çünkü büyük ayrıştırıcılar, bitki simbiyotları ve parazitler gibi davranırlar. bunu yaparak atmosfere. Böylece karbon döngüsünün ana parçalarıdır.
Ahşabın ayrıştırılması en önemli rollerinden biri olmasına rağmen, mantarlar diğer organik maddeleri de ayrıştırır. Mantarlar ayrıca toprağın işlenmesine, otların parçalanmasına ve hayvan pisliğinin parçalanmasına yardımcı olur. Bu ayrıştırıcılar olmadan, bu materyaller, diğer organizmalar için faydalı materyallere dönüştürülmeden önce çevrede daha uzun süre beklerler.
Diğer mantar türleri ağaçların büyümesine yardımcı olur. Bu mantar türleri ağaç kökleri ile iç içe geçerek ağaçlara bazı gerekli mineralleri daha erişilebilir hale getirmek için su ve organik bileşikler alır. Tek tek mantar türleri genellikle belirli bir ağaç türüne özgüdür. Mantarlar genellikle ağaçlar olmadan yaşayamazlar, ağaçlar mantarlar olmadan da iyi büyüyemezler.
Paraziter mantarlar hem bitkilere hem de hayvanlara saldırarak çok yıkıcı olabilir. Bunlar en tehlikeli bitki patojenlerini içerir. Yalnız bir türün milyarlarca kestane ağacının tahrip edildiğinden şüpheleniliyor. Mantar parazitleri ayrıca insanlara saldırabilir ve bazı zatürree türleri gibi hastalıklara neden olabilir.