Eubacteria krallığı için dört farklı beslenme modu vardır: fotoototroflar, kemoautotroflar, fotoheterotroflar ve kemoheterotroflar. Bunların her birinin enerji ve karbon elde etmenin farklı bir kombinasyonu vardır.
Fotoototroflar, bitkileri benzer şekilde kullanarak, enerji üretmek için ışık ve karbon bileşikleri üretmek için karbon dioksit kullanan fotosentez yapan organizmalardır. Kemoototroflar ayrıca karbon bileşiklerini yapmak için karbon dioksit kullanırlar, ancak ışıktan ziyade enerji kaynağı olarak inorganik kimyasallar kullanırlar. Fotoheterotroflar enerjilerini güneş ışığından alırlar, fakat aynı zamanda bir karbon kaynağı olarak organik karbon bileşiklerini de alırlar. Kemoheterotroflar hem enerji hem de karbon elde ederek organik kimyasalları alırlar. Her durumda, kimyasalları metabolize ederek enerji üretirken, enerji kaynağına elektron donör denebilir ve bu donörün işlenmesi genellikle en yaygın oksijen olan elektron alıcısı gerektirir.
Enerji için kimyasal madde alımına dayanan bakteri ya oksijene bağımlı olabilir ya da diğer elektron alıcılarını kullanabilir. Oksijensiz kimyasal bileşiklerden enerji üreten bakteriler anaerobik solunum veya fermantasyon kullanır. Anaerobik solunum, nitratlar, sülfatlar veya karbondioksit gibi alternatif elektron alıcılarının kullanılmasını gerektirir. Enerji üretmek için inorganik bileşikler kullanan bakteriler de yaygın olarak hidrojen, karbon monoksit, amonyak veya indirgenmiş metalleri kullanabilir. Fermantasyon, herhangi bir alternatif elektron alıcısı kullanmaz, bunun yerine etanol veya laktik asit gibi atık ürünler üretir.
