Bazı türler hastalığa neden olabilse de, mantarların çoğunluğunun insanlar üzerinde olumsuz bir etkisi yoktur. Buna bir örnek, Üniversiteye göre, solunum koşullarına neden olan ve daha da şiddetlendiren iç mekan küfü Minnesota’dan.
Mantarların çoğunluğu insanlara zarar vermese de, yapanların ciddi etkileri olabilir. Örneğin, topraktan gelen fırsatçı mantarlar, diyabet hastası gibi bağışıklık sistemi bozulan bir kişinin yarasına girerse agresif bir enfeksiyona neden olabilir. Mantarların neden olduğu enfeksiyonların çoğu yüzeyseldir, bu da ciltte veya saçta meydana geldiği anlamına gelir. Bunun örnekleri sporcunun ayağı ve saçkıranı içerir.
Mantarlar vücuda enfeksiyon olarak girdiğinde ölümcül olan sistemik reaksiyonlara neden olabilirler. Küfün bulunduğu hanelerde yaşayan insanlar yüzeysel ve içsel enfeksiyon geliştirme riski altındadır. Karşılaştıkları enfeksiyon tipi ve ne kadar şiddetli olduğu mantar tipine ve ne kadar toksik olduğuna bağlıdır. Örneğin, yeşil küf soluyan insanlar, diğer tür solunanlardan daha yüksek risk altındadır. Küf solumasından kaynaklanan sağlık sorunları alerjik reaksiyonlar, alerjene maruz kalma sonucu sinüzit, pnömoni ve alerjik astımdır.