Mantarlarda laktofenol pamuk mavisi ile lekelenme mekanizması laktofenolün temizlik maddesi olarak kullanılmasıdır, bu da organizmayı öldürebildiği anlamına gelir. Daha sonra laktik asit, mantarın yapısını korur. Pamuk mavisi, sitoplazmayı belirli bir açık mavi renk tonu ile lekeleyebilir, böylece bilim adamlarının mantar hücrelerini içeren slaydı gözlemlemeleri mümkündür.
Bir hücrenin bir örneğinin boyanması, hücrenin belirli bölümlerinin görsel olarak birbirinden renklendirilmesi veya ayırt edilmesi işlemidir. Bu, bilim adamlarının hücrenin parçalarını ayırt etmelerini ve onları daha net gözlemlemelerini sağlar. Ökaryotik organizmaların boyanması bazı biyolojik işlemlerin ve olayların insan tarafından anlaşılması için hayati öneme sahip olabilir. Bazı mantar türlerini anlamak, antibiyotiklerin ve diğer ürünlerin geliştirilmesinde yardımcı olabilir ve tarım endüstrisindeki hastalıkların fermantasyonu veya önlenmesi için bile kullanılır.
Laktofenol pamuk mavisi boyama tekniğini kullanırken, bir bilim adamının temiz bir slayt alması ve üzerine bir damla laktofenol pamuk mavisi çözeltisi eklemesi gerekir. Ardından, sterilize edilmiş bir iğne başka bir kayma ile kaplanmadan önce bir matı bu sıvının üzerine aktarabilir. Bu laktofenolün organizmayı temizlemesini ve öldürmesini sağlar ve laktik asit şeklini korur. Hücre daha sonra boyanabilir ve gözlenebilir.