Silikon, ilk olarak 1824'te İsveçli kimyager Jöns Jacob Berzelius'un laboratuvarında izole edildi. Berzelius, silikatlı kaya kırılmaya başlayana kadar bir toprak kapta potasyum ısıtılarak örneğini çıkardı. Safsızlıkları yıkadığında Berzelius, neredeyse saf bir silikon örneğiyle kaldı.
Silikon göreceli bolluğu nedeniyle diğer birçok kimyasal elementten daha erken keşfedildi. Silikon hafiftir, dolayısıyla yıldızlardaki nükleer reaksiyonlarla kolayca sentezlenir. Bu gerçek, göreceli kararlılığı ile birlikte, silikonu Dünya'nın kabuğundaki en belirgin ikinci elementin yanı sıra evrendeki en yaygın yedinci elementtir.