Pratik jel elektroforezi uygulamaları arasında bakteri yazmak, kaynakları izlemek ve hastalığın yayılmasını izlemek, aşı tasarımı için bakteriyel evrimi izlemek ve adli vakalarda bir kimliği teyit etmek yer almaktadır. farmakoloji, kanser araştırması, madencilik ve bira üretimi.
Jel elektroforezi, hedeflenen maddeyi içeren bir çözelti uygulandıktan sonra bir elektrik yükünün gözenekli bir malzemeden geçirilmesini gerektirir. DNA, RNA ve proteinler farklı ekstraksiyon, jel hazırlama ve tamponlama yöntemleri gerektirir. Elektroforez, daha kısa tellerin farklı molekülleri ayırarak daha yüksek hızlarda bir jel ortamından geçmesi gerçeğini kullanır. Lekeleme, tek tek telleri tanımlama için seçer. Edward M. Southern, jel elektroforezinin sonuçlarını bir zara aktarıp, daha ileri araştırmalar için moleküllerin nispi konumlarını koruyarak bir teknik geliştirdi. DNA için Southern Blot, RNA için Northern Blot ve protein için Western Blot'tan ilham almıştır. Başka bir arıtma, dayanıklı ve tekrar kullanılabilir sonuçlar elde etmek için yüklü Naylon membranlar kullanır. Koşullar farklı yaklaşımlar gerektirdiğinde diğer moleküler tanımlama türleri jel elektroforezini destekler. Kılcal elektroforezi, daha az tutarlı okumalar pahasına, küçük parçacıklara karşı hassasiyeti arttırır. Peptit nükleik asit (PNA) analizi, alanda hızlı şarbon DNA ve HIV RNA tanımlamasına olanak tanıyan bir yüzey sondası ve raportör sondası birleştirir.
