İkili fisyon, bakterilerin aseksüel olarak çoğaldıkları ana işlemdir. Hücrenin büyüdüğü, DNA'sının çoğaltıldığı ve her birinin bir hücreye bölündüğü bir hücre olarak özetlenebilir DNA'nın kopyası. Bakteriler genellikle uygun koşullar altında sadece ikili bölünmeye uğrarlar.
İkili fisyon, kopyalanan DNA'yı hücrenin diğer taraflarına taşımak ve sonra hücreyi ikiye bölmek için hücresel makinelerin kullanılmasını içerir. Bölme hücresinin ortasına, özel bir halka tipinde çoklu üniteler monte edilir ve bunlar daha sonra her bir hücre arasında kapalı hücre zarını sıkıştırarak daralmaya başlar. Diğer hücresel makineler, hücresel membran daraldığı için DNA'nın zarar görmemesini sağlar. Birçok bakteri türünde, hücre zarı kapalı tutturuldukça, yeni hücreler arasında yeni hücreler arasında da inşa edilir.
İkili fisyon bakteriler için en yaygın üreme şekli olmasına rağmen, kullanılan tek yöntem bu değildir. Bazı fotosentetik bakteri türleri bunun yerine çok büyük bir boyuta büyür ve dağılmadan önce yuvarlak bir kabuk içinde birçok kez bölün. Diğer türler, bölücü bir hücreden iki eşit kız hücreden ziyade çok daha küçük kız hücrelerini meydana getirerek tomurcuklanır ve çoğalırlar.