İki atomlu toprağa maruz kalmanın parazitleri gidermek gibi olumlu yan etkileri ve göz veya akciğer tahrişi gibi olumsuz yan etkileri olabilir. İki atomlu toprağın yan etkileri, maruz kalmanın özel koşullarına bağlı olarak değişir.
Diatomlu toprak, örümcekleri ve benzeri zararlıları uzaklaştırmak için tipik olarak evde ve bahçede kullanılan toz benzeri bir maddedir. Toz havalanırsa, kişinin mukoza zarlarına girip göz tahrişine neden olabilir veya toz solunabilir ve öksürüğe ve diğer akciğer tahrişine neden olabilir. Amorf ve kristalin diyatomlu toprak, toz gözlere girdiğinde veya burun veya ağızdan solunduğunda kısa veya uzun vadeli yan etkilere neden olabilir.
Prosessiz Amerika'ya göre, gıda sınıfı diyatomeli toprağın küçük miktarlarda tüketildiğinde bazı sağlık yararlarına sahip olduğu düşünülüyor. Örneğin, olumlu yan etkilerden bazıları, parazitlerin uzaklaştırılmasını, kolesterol seviyelerinin düşürülmesini ve sindirimin iyileştirilmesini içerebilir. İki atomlu topraktaki aktif bileşen, insan vücudunun ihtiyaç duyduğu bir besin maddesi olan silikadır.
Kristalin diatomlu toprak, insan tüketimi için güvenli değildir ve kristalin diatomlu toprak solunduğunda meydana gelen bronşiyal tahriş gibi zararlı yan etkilere sahip olabilir. Amorf, gıda sınıfı diyatomlu toprak çoğu uygulama için güvenlidir ve tipik olarak uzun vadeli, olumsuz yan etkilerle ilişkili değildir. Bununla birlikte, kristalin diyatomeli toprağın, Ulusal Pestisit Bilgi Merkezi'ne göre, uzun süre tekrarlanan, bazı kanserlerin riskini arttırdığı gösterilmiştir.
