Bir hücre ve bir organel arasındaki fark, bir organelinin ökaryotik bir hücrenin parçası olduğudur. Bir hücre, genellikle bir organizmanın kendi kendine yeten en küçük kısmı veya bağımsız olarak çalışan birimi olarak kabul edilir organeller, ökaryotik hücrelerde, çeşitli işlevleri yerine getiren daha küçük yapılardır.
Ökaryotik hücreler kısmen, iyi tanımlanmış çeşitli organelleri içerdikleri veya oluşturuldukları gerçeğiyle tanımlanırken, prokaryotik hücreler organeller içermez. Organeller, hücrenin içinde bir bütün olarak hayatta kalmasına ve işlevselliğine katkıda bulunan farklı işlevleri yerine getiren hücre içindeki küçük yapılardır.
Bir hücrede bulunan organel tipleri, hücre tipine göre değişir. Örneğin, fotosentez işleminden sorumlu olan kloroplastlar bitki hücrelerinde bulunur, ancak hayvan hücrelerinde yoktur. Kloroplastlara ek olarak, organellerin diğer bazı yaygın örnekleri hücre çekirdeği, ribozomlar, mitokondri, vakuoller ve Golgi gövdeleridir.
Her organel türü özel işlevler veya işlemler gerçekleştirir. Örneğin çekirdek, hücrenin genetik bilgisini kromozomlar şeklinde barındırır ve hücre bölünmesinden sorumludur. Mitokondri, hücrenin geri kalanının hayatta kalması ve kendine özgü ve hücre çekirdeğinde bulunan genetik malzemeden kendine özgü genetik materyal içermesi gereken enerjiyi üretir. Vacuoles, bitki ve hayvan hücrelerinde biraz farklı görünümlere sahipken, içinde bulundukları hücre türü ne olursa olsun enerji depolarlar.