Helyum 4.00 atomik kütle birimine sahip bir atom kütlesine sahiptir. Gazlı element ayrıca atom numarası 2'ye ve He'nin atom sembolüne sahiptir. Atom numarası, elementin nötronları kütlesinden belirlenebilirken elementin sahip olduğu proton ve elektron sayısı ile ilişkilidir.
Helyum tam olarak iki proton ve iki elektrona sahiptir; atom numarası 2'dir. Atom kütlesi eksi atom numarası ikiye eşit olduğundan, iki nötronu da vardır. Element, soy gaz olarak sınıflandırılır ve periyodik tablodaki grup 18'de bulunur. İnert bir atomdur çünkü sekiz değerlik elektronuna sahiptir ve tamamen kararlıdır.
