Ham petrol, çevreye tehdit oluşturan ve ayrıca üretken kullanımı zorlaştıran çeşitli dezavantajlarla birlikte gelir. Bunlar çevre kirliliği ve kontrolsüz çıkarma ve tükenmeyi içerir.
Ham petrolün en büyük dezavantajı çevreye yarattığı tehdit. Yandığında solunan havayı kirleten ve ozon tabakasını paslandıran karbondioksit üretir. Boru ile taşımacılığın standart olmadığı durumlarda, yağ toprağa zarar verebilir ve mikroorganizmaları etkileyebilir. Öte yandan, kamyonlarla yapılan taşımacılık, karayollarını tahrip eder ve kaza durumunda yangın riski oluşturur.
Rafine yağ ve petrol gibi, ham petrol de yakma için yakıt olarak kullanılabilir. Ne yazık ki, diğer yakıt kaynaklarının aksine yenilenebilir değildir. Bu nedenle, kontrolsüz çıkarma ve kullanım yalnızca ham petrolün oluşumu milyonlarca yıl alabileceğinden gelecek nesiller için kaynakları tüketmektedir.
Ancak ham petrol yanabilirken, sürüş, uçma ve hatta motorlara güç verme gibi birçok uygulamada kullanmak mümkün değildir. Bu amaçla, diğerleri arasında benzin, dizel ve kerosen gibi ürünler haline getirilmelidir. Bu, hava kirliliğine ve kapsamlı toprak sondajına yol açan pahalı bir süreçtir.