Plazmidler, rekombinant genetik materyali çoğaltmak için genetik mühendisliğinde kullanılır. Bir bakteri içine bir plazmid yerleştirildiğinde, bakterinin çoğalması, rekombinant DNA'nın daha fazla kopyasını oluşturması teşvik edilir.
Plazmidlerin klonlanmasına izin veren kısımlara ek olarak, plazmidler, bu ifadeyi tahrik eden ekspresyon vektörlerini ve promotör sekanslarını içerir. Genetik belirteçler araştırmacılara plazmidin var olduğunu bildirir. Bazı plazmitler antibiyotik direnci içerir; Bir bakteri popülasyonuna bir plazmid uygulandıktan sonra, antibiyotikler eklenir. Bakteriler ne hayatta kalırsa antibiyotikler plazmid içermelidir. Bazen, plazmidler karanlıkta parlayan proteinleri eksprese ederek araştırmacıların popülasyonun ne kadarının plazmiti içerdiğini kolayca belirleyebilmelerini sağlar.
Bazı plazmitler, bakteriler arasında genetik materyal alışverişi olan konjugasyon yoluyla çoğalır. Bu yöntem daha hızlıdır çünkü bakteriler üremeye gerek kalmadan plazmidi yayarlar.
Bakterilerde rekombinant DNA'nın nihai amacı, genellikle insan kullanımı için proteinler üretmektir. Bu nedenle, plazmidler sıklıkla çözünürlüklerini arttırmak gibi bu işlemi kolaylaştıran saflaştırma etiketlerini içerir.
Plazmitler sadece bakterilere uygulanmaz. Bakteriyel (prokaryotik) bir vektör kullanırken, insanlar için gen tedavisi genellikle plazmidler kullanılarak yapılır.