Fosfor döngüsü, temel bir besin maddesi olan fosfor elementinin bileşiklerinin çevrede geri kazanılma şeklidir. Bitkiler, topraktaki fosfor bileşiklerini ve her iki bitki maddesi de dahil olmak üzere organik maddeyi çürütür ve hayvan dışkısı, toprağa geri verir. Fosfor, ATP'nin hayati bir parçasıdır, tüm hücrelerin enerji para birimidir ve tüm yaşam biçimleri için hayati öneme sahiptir.
Fosfor döngüsü mükemmel değil. Kayıplar, esas olarak yağmurun nihayetinde nehirlere ve denize doğru fosfor yıkayan yağmur eylemiyle oluşur. Neyse ki, istikrarlı bir ekosistemde bu kayıplar minimumdur ve diğer doğal süreçler arzı yeniler. Özellikle, kayaların ayrışması çevreye yeni fosfor bileşikleri salmaktadır. Fosfor, hem bitkilerin hem de alglerin büyümesinde önemli bir sınırlayıcı maddedir. Yeterli fosfor bulunmadığında, bitki büyümesi bodurdur.
Bu fosfor kaybı, bitkilerin birçok elementinin büyüdükleri topraktan uzağa taşındığı çiftliklerdeki bir problemdir, dolayısıyla fosfor döngüsünün çok önemli bir bölümünü meydana getirir. Bu nedenle, geleneksel tarım yöntemlerini kullanan çiftçiler topraklarını geliştirmek için gübreler kullanmalıdır. Bununla birlikte, bazı küçük ölçekli tarım türleri, toprakları tüketmek ve fosfor içeren atıkları toprağa geri göndermek için çok daha yavaştır.