Fermantasyon, hücrenin sitoplazmasında gerçekleşir. Prokaryotik hücrelerde, tüm metabolik işlemler sitoplazmada gerçekleşir; ökaryotik hücrelerde, sadece fermantasyon sitoplazmada gerçekleşir. Ökaryotlarda diğer solunum şekilleri mitokondride gerçekleşir.
Ökaryotik hücrelerde, fermantasyon genellikle oksijensiz ortamda gerçekleşir. Ortamlarda bile fermantasyondan yararlanan mayaların oksijen mevcut olduğu bu kuralın istisnası. Mitokondride metabolik süreçler oksijen gerektirir, bu nedenle fermantasyonun sitoplazmada meydana gelmesidir.
Mayalarda fermantasyon etanol üretir. Fermantasyon kullanan hayvan hücreleri ve prokaryotlar laktik asit üretir. Hayvanlarda, laktik asit fermantasyonu, oksijen bulunmadığında kas hücrelerinde kullanılan bir geri dönüş işlemidir. Bu fermentasyon türü yalnızca memelilerin kas hücrelerinde meydana gelir.
Laktik asit üreten bakteriler, fermente gıdaların üretiminde kullanılır. Bunlara yoğurt, lahana turşusu, kimchi ve bazı ekşi biralar dahildir. Diğer biralar ve şaraplar, etanol üreten maya fermantasyonuyla üretilir. Ekmek hamuru maya fermantasyonunda yükselir; Atık ürün olarak üretilen karbon dioksit, hamurun yapısını veren kabarcıkları oluşturur. Endüstriyel olarak fermantasyon, biyoyakıt üretmek, hidrojen üretiminde ve su arıtma tesislerinde insan atığını arıtmak için kullanılır.
