Eubakteriler, aseksüel olarak ikili füzyon yoluyla çoğalırlar. İkili füzyon, bakterinin genetik materyalinin, iki ana bakteri hücresine iki aynı bakteri hücresine bölünmesiyle sonuçlanan tam bir kopyasıdır. Her 20 dakikada bir bölüştürülür ve eubakterilerin şaşırtıcı bir şekilde çoğaltabildiğini gösterir.
İkili füzyonun başlangıcında, bir eubacteria hücresinin genetik materyali, iki küme kromozom grubu oluşacak şekilde kopyalanır. Bu iki kromozom kopyası, ayrı nükleotit bölgelerine hareket eder ve plazma zarı, iki kopya arasında büyümeye başlar. Bu kopyalar orijinal boyutlarını iki katına çıkardıktan sonra, plazma zarı birlikte sıkıştırılarak, orijinal eubacteria hücresini iki kız hücreye ayırır. Bu iki kızak hücre birbirinden bağımsızdır, ancak bazen bağlı kalabilir. Bu bağlantı bazı türlerde kolonileri oluşturan şeydir. İkili füzyon yoluyla üretilen hücreler genetik olarak özdeş olduklarından, antibiyotiklerle kolayca imha edilirler. Buna karşı koyabilmek için eubacteria konjugasyon, transdüksiyon ve transformasyon yoluyla yeniden birleşir.
Bakteriler bir tür eubakterilerdir ve bazıları tehdit koşulları geçene kadar dinlendikleri “spor” olarak adlandırılan hareketsiz bir aşamaya girme kabiliyetine sahiptir. Sporlar sıcağa, şiddetli kuruluğa, radyasyona ve toksik kimyasallara karşı dirençlidir.
