Dünyada 42 milyondan fazla penguen olduğu tahmin edilmektedir. Bazı penguen türlerinin popülasyonlarındaki dalgalanmalar nedeniyle kesin bir rakam elde etmek zordur.
17 farklı penguen türü var. Tahmini 9 milyon çiftleşme çiftiyle en kalabalık tür Subantarctic ve Antarktika yarımadasındaki adalarda yaşayan makarna penguenidir. Ekvator kıyılarındaki Galapagos adalarında yaşayan Galapagos penguenleri, yaklaşık 1.200 olgun bireyde en düşük nüfusa sahiptir.
Pek çok Penguen türü, Nesli Tükenmekte Olan Türler Yasası tarafından tehdit altında veya tehlike altında listeleniyor, ancak Adelie pengueni gibi bazı türler sayılarını artırıyor.
