Bilinen tüm penguen türleri doğal olarak dünyanın güney yarım küresinde yaşar. Aslında, güney yarım küredeki beş kıtanın her birinde bulunan habitatları işgal ederler.
Soğuk ve soğuk sıcaklığıyla bilinen Antarktika, İmparator penguen gibi en büyük ve en ünlü penguen türlerine ev sahipliği yapar. Popüler inanışın aksine, penguenler kuzeyi veya güneyi kutuplarını işgal etmiyor. Penguenlerin çoğu daha soğuk iklimleri tercih eder, ancak biraz daha sıcak bir iklimi tercih eden bazı türler vardır. Galapagos pengueni, ekvatorun yanında bulunan Galapagos Adaları'nın yakınında, kuzeyde bulunur. Humboldt akımının soğuk sularının yardımı ile bu sıcak iklimde hayatta kalırlar. Penguenler avcılardan kaçmak için uçamadıklarından, çok sayıda kara avcıdan arınmış adalar ve karasal alanlarda yaşama eğilimindedirler. Antarktika beş üreme penguen türüne ev sahipliği yapar. Diğer penguen habitatları arasında Kuzey Şili, Peru, Güney Şili, Arjantin, Namibya, Güney Afrika, Avustralya ve Yeni Zelanda sayılabilir. Penguenlerin yaşadığı dünyadaki diğer yerler Kerguelen Adaları, Falkland Adaları, Bouvetoya ve Güney Sandwich Adaları'dır.