DNA’daki baz çiftleri timine ve guanine sitozin için adendir. RNA’da, uracil ve guanine sitozin için adenindir.
Bir baz çifti iki nükleotidden oluşur. Karşı DNA veya RNA iplikçiklerinde bulunan nükleotitler, birbirine bir hidrojen bağında çekilir. Bu bağlar, ipliği çift sarmal oluşumunda bir arada tutan şeydir. İkili yapı, genetik bilgiyi saklamak için bir yedekleme sistemi görevi gören bir artıklıktır.
Baz çiftleri, DNA'da kodlanan genetik bilginin RNA'ya aktarıldığı işlem olan transkripsiyonu kolaylaştırır. Bilgi, kodlama şeridi adı verilen iki DNA dizisinden sadece birinde taşınır. Kodlama zincirindeki her nükleotid, şablon zincir olarak adlandırılan diğer zincirde tamamlayıcı bir nükleotite sahiptir.Watson-Crick çiftleri standart DNA ve RNA baz çiftleridir. DNA'da adenin timine bağlanırken, guanin sitozinle bağlanır. Aynı çiftler, RNA'ya uygulanır; ancak, urasil, timinin yerine geçer. Urasil ve timin molekülleri, adenin ile aynı tip hidrojen bağlarını oluşturmalarına izin verecek şekilde çok benzerdir.
Bununla birlikte, diğer hidrojen bağlarından kaynaklanan bazı alternatif bağ çiftleri vardır. Bir yalpalama baz çiftinde, guanin urasile bağlanır, hipoksantin urasile bağlanır, hipoksantin adenin bağlar ve hipoksantin sitozin bağlar. Bir Hoogsteen baz çifti başka bir alternatif oluşumdur. Hoogsteens ve yalpalamalar en sık RNA'da görülür ve oldukça karmaşıktır.