Stereo mikroskop olarak da bilinen diseksiyon mikroskopları, elde edilen numunelerin üç boyutlu görüntülerini elde etmek için kullanılan bilimsel araçlardır.
Diseksiyon mikroskoplarının avantajları ve dezavantajları vardır. Bunlar, üç boyutlu görüntüler üretebilen ve tipik bileşik mikroskoplara kıyasla daha yüksek bir alan derinliğine sahip olan tek mikroskoplardır. Üç boyutlu görüntüleri, nesnelerin tam yerini ve işlevini belirlemede faydalı olabilir. Ancak, küçük bir büyütme var. Bu, kullanıcının oldukça ayrıntılı görüntüler görmesini engeller, ancak nesnenin daha büyük bölümlerinin aynı anda görüntülenmesine izin verir.