Pürüzsüz endoplazmatik retiküller, ribozomlar, vaküoller, lizozomlar ve centrozomlar, çekirdeğinde bulunmayan bir hücrenin sayısız bileşeni arasındadır. Bu yapıların tümü, nükleer ve hücre zarları arasında bulunur. .
Bir hücrenin çekirdeği, hücrenin geri kalanından çift katmanlı bir zardan ayrılır. Bir hücrenin organellerinin çoğu çekirdeğin dışındadır. Çekirdeğin içinde, nükleoplazma ve nükleoli gibi bazı özel yapılar vardır. Çekirdeğin önemli DNA fonksiyonlarına sahip olması nedeniyle, DNA ve RNA'yı sentezlemek için kullanılan malzemeleri de içerir. Ökaryotik hücreler, çekirdeklerinin içinde birkaç kromozom içerir. Çekirdek ayrıca, nükleoplazma adı verilen sitoplazmaya benzer bir sıvı içerir.