Çekirdek, nükleer zarf adı verilen bir zarla bir arada tutulur. Zarf, çekirdeğin içeriğini sitoplazmadan ayırmak için bir lipit çift tabakası oluşturan fosfolipitlerden oluşur.
Lipit iki tabakası, 10 ila 50 nanometre ile ayrılmış bir iç ve dış tabakadan oluşur. İki katman arasındaki boşluğa perinükleer boşluk denir. Ek olarak, zarf, çekirdek şeklini verir ve çekirdeklerin gözeneklerinin içine ve dışına giren moleküllerin akışını kontrol etmeye yardımcı olur. Gözeneklerin büyüklüğü küçük, suda çözünür moleküllerin geçişine izin verirken, daha büyük moleküllerin çekirdeğe serbest geçişini önler. Tipik memeli hücrelerinin zarfında kabaca 3000 ila 4000 gözenek bulunur.
Çekirdeğin işlevi, hücre ekspresyonu sırasında gen ekspresyonunu ve DNA replikasyonunu izlemek ve kontrol etmektir. Bir sitoplazmik işlem izolasyon gerektirdiğinde, ana parçalar çekirdeğe kaldırılır.
Çekirdeğin içindeki nükleol, nükleolar düzenleyici bölgeleri içeren bir RNA ve protein kütlesidir. Bunlar ribozom sentezi için gen içeren kromozom kısımlarıdır. Çekirdeğin tersine, nükleolün bir zarı yoktur ve bir alt-organel olarak adlandırılır. Çekirdek birkaç tür alt nükleer yapı içerebilir.
