Bitkiler tarafından üretilen ikincil metabolitler, bitki metabolizmasında büyüme, fotosentez, üreme ve diğer birincil fonksiyonlar dahil olmak üzere tanımlanmış bir rolü olmayan kimyasallardır. Bitkiler tarafından üretilen birçok ikincil metabolit insan yaşamında kilit rol oynar.
Bitkiler tarafından üretilen bir tür ikincil metabolit, flavonoidler, antioksidan özelliklere sahip olarak lanse edilir ve insanlar tarafından bu faydalar ve ayrıca antienflamatuar özellikler için tüketilir. Flavonoidler ayrıca Vitamin P veya sitrin olarak da bilinir. Fındıkta, tohumda ve diğer yiyeceklerde bulunan ikincil bir metabolit olan fitoöstrojenler, östrojen hormonunu taklit eden kimyasallardır. Kemik ve kalp sağlığını korudukları düşünülmektedir.