Büyük merkezi vakuolün bitki hücrelerinde temel işlevi yapısal destek sağlamaktır; bununla birlikte, koruma, depolama, büyüme ve atık imhası gibi diğer işlevlere de hizmet eder. Bu büyük merkezi vakuol, tipik olarak, daha küçük ve genel olarak daha küçük olan hayvan hücreleri vakuollerinin aksine, hücredeki alanın en az yüzde 80'ini kaplar maddeleri taşımak veya geçici olarak depolamak için kullanılır.
Bu büyük merkezi vakuolü içine almak için tonoplast olarak bilinen bir zar kullanılır. Hücre olgunlaştıkça, bu büyük merkezi vakuol, yavaş yavaş Golgi aparatından ve endoplazmik retikulumdan türetilen küçük vakuların füzyonu sonucu gelişir. Merkezi vakuolün bitki hücrelerinde, bazıları bitkinin büyümesine yardımcı olan ve bitki için hayati bir yapısal rol oynayan tuz, besin, pigment, mineral, protein depolanması gibi birçok rolü vardır.
Koşullar optimum olduğunda, su boşlukları hücrelerin duvarlarına karşı basınç uygulayacakları noktaya kadar doldurur. Bu, bitkinin yapısal bütünlüğünü korumaya yardımcı olur ve bitkinin yeni sitoplazmayı sentezlemeden büyümesini sağlar. Vakumun yapısal kapasitesinin önemi, hücrenin sertliğini belirleyen turgor basıncını kontrol etme kapasitesi ile ilgilidir.
