Her amino asit, kodon adı verilen üç baz üçlü kodundan oluşur. Kodonlar, mevcut dört nükleotidin üç kombinasyonundan oluşur. 64 adet potansiyel kodon kombinasyonu vardır.
Hangi kodonların kullanıldığı, oluşturulan amino asit tipini belirler. Üçlü dizisindeki kodonların sırası hangi proteinin oluşturulduğunu belirler. 64 kombinasyonun altmış biri proteinlerdeki amino asitleri oluşturur. Geri kalan kombinasyonlar, zincirin sonlandırılmasını veya durma sekanslarını oluşturur. Eş anlamlı kodonları adı verilen çoklu kodonlar, aynı amino asidi kodlayabilir. Eş kodonların bir zincirde bulunması durumunda, zincirin dejenere olduğu söylenir.
