Bilim adamları, doğrudan gözlemleyemediklerini tahmin etmek ve anlamak için birçok fiziksel model kullanırlar. Fiziksel modeller, atomun Bohr modelinden gezegenlerin etrafındaki yörüngeleri gösteren evrenin modellerine kadar uzanır Güneş. Genellikle, modeller çok daha küçük veya daha büyük bir şeyi daha küçük yapar.
Atomun Bohr modeli, elektronların yörüngelerinin doğasını tasvirinde doğru olmasa da, Encyclopedia Britannica'ya göre, kuantum teorisini içeren ve elektron davranışının anlaşılmasını sağlayan ilk fiziksel modeldi. Her fiziksel modelin kendi sınırlamaları vardır ve her zaman doğada olanların tam bir temsilini sunmaz.
Çift sarmal, bilim insanlarına DNA yapılarını ve gen üreme işlevini görselleştirmede yardımcı olan fiziksel bir DNA modelidir. Bu modelin oluşturulması, diğerleri gibi, deneysel verilerin kullanımına da bağlıydı.
Bilim adamları genellikle bilgisayar tarafından üretilen modelleri fiziksel modellerle birlikte kullanırlar. Sınırlamalar olsa da, bilgisayar tarafından üretilen modeller fiziksel modellerden daha fazla ayrıntı sağlayabilir. Örneğin, The Atlantic tarafından tarif edilen bir evrenin bilgisayar modeli, her biri 12 milyar üç boyutlu pikselden oluşan, 350 milyon ışıkyılı küp küp haline getirildi. Evrenin boyutunu fiziksel bir modelle yakalamaya çalışmak çok daha az etkileyici bir sonuç verir.