Farklı bakteri türleri, şekillerine göre beş kategoriye ayrılır: koki, basil, vibrios, spiroketler veya spirilla. Cocci küreseldir, basiller çubuk şeklindedir. Vibrios virgül, tirbuşon ve spirilla benzeri spiraller gibi spiroketler şeklindedir.
Bakterilerin çoğu kok, basil veya spirilla kategorisindedir. Doğada, bakteri tek hücre olarak veya çiftler halinde, kümeler halinde veya zincirlerde bulunabilir. Belirli bir şekilde bir bakteri hücresi kolonisine, hücrelerin grup içinde nasıl düzenlendiğine bağlı olarak adlandırılır. Örneğin, diplococci terimi, çiftler halinde düzenlenmiş bir coccus veya küresel bakteri anlamına gelir. Bu arada, streptokoklar zincirlerde düzenlenmiş küresel bakterilerdir ve stafilokoklar kümelerde düzenlenmiş küresel bakterilerdir.
Streptococcus pyogenes ve Streptococcus pneumoniae, insanlarda hastalığa neden olabilen cocci örnekleridir. Streptococcus pyogenes, strep boğazının kasılmasından sorumlu bakteri türüdür; Streptococcus pneumoniae, bir kişinin akciğerlerini enfekte edebilir, zatürreye neden olabilir ve enfekte birey öksürdüğünde yayılabilir. Bununla birlikte Streptococcus thermophilus, sütün yoğurt haline dönüşmesine yardımcı olan yararlı bir kokküstür. Menenjit ve cinsel yolla bulaşan enfeksiyon gonore, aynı zamanda kok kategorisindeki bakterilerden de kaynaklanır.
Escherichia coli, ortamına bağlı olarak zararsız veya zararlı olabilecek bir basildir. Kalın bağırsağın içindeyken, bağırsak florasının normal bir bileşeni olarak davranır. Bununla birlikte, kan dolaşımında, akciğerlerde veya sindirim sisteminde olduğu gibi, vücudun herhangi bir yerinde hastalıklara neden olabilir.