Mikrobiyolojinin babası olarak bilinen Anton Van Leeuwenhoek, 1676'da bakteri gözlemleyen ilk kişiydi. İlk bileşik mikroskoplardan birini kullandı ve havuz suyunda "mağaracılık" olarak adlandırdığı şeyi buldu. .
Anton van Leeuwenhoek ayrıca üreme sürecini incelemek için mikroskop teknolojisini kullandı. Sperm ve çeşitli türlerin yumurtalarını ilk gözlemleyen oydu. Anton van Leeuwenhoek mikroorganizmalar denilen canlı tek hücreli organizmaları gözlemleyen ilk kişi iken, hücreleri ilk gözlemleyen kişi değildi. Robert Hooke, ilk önce 1663'te bileşik bir mikroskop altında mantar dilimlerine bakarak hücreleri inceledi. Sonuç olarak, hapishane hücrelerinin görünümü ile tekrarlanan yapıları ve bunun sonucunda da "hücreler" yapıları adını verdi.
