Her zaman amino asitlerde bulunan iki fonksiyonel grup karboksil ve amino gruplarıdır. Her iki grup da asittir. Bir amino asidin karboksil grubu, bir diğerinin amino ucuna katıldığında bir peptid bağı oluşur.
Bir karboksil grubu bir karbon atomu, iki oksijen atomu ve bir hidrojen atomundan oluşur. Amino grubu bir azot atomu ve iki hidrojen atomundan oluşur. Karboksil ve amino grupları, bir amino asidin zıt uçlarında bulunur.İki amino asit, birleşince bir peptid veya amid bağı oluşturur. İki amino asidin amino ve karboksil uçları bir araya gelir ve amino grubunun azotu, karboksil grubundaki karbonla bağlanır. Amino grubundaki hidrojenler ve karboksil grubundaki bir oksijen, bir su molekülü oluşturmak üzere birleşir.
