Amazon yağmur ormanlarında yetişen bitkiler arasında kakao ağaçları, avokado ağaçları, tutku çiçekleri, guava ağaçları ve tatlı patates üzümleri bulunur. Bazı Amazon bitki türleri, orkideler, yosunlar ve eğrelti otları gibi toprakta değil, başka bitkilerde yetişir.
Amazon yağmur ormanı, 80.000 farklı bitki türü içerir. Her 2,5 dönümde 40 ila 100 farklı tür bulunur.
Yağmur ormanlarındaki bitkilerin çoğu tıpta, gıdada ve kozmetikte kullanılır. Örneğin, kakao tohumları çikolatanın ana kaynağıdır. Avokado ağaçları yenilebilir, yüksek protein içeren bir meyve üretir. Sakızdaki en önemli terkip maddesi, chicle ağacından türetilmiştir. Vanilya asması, vanilya özünün alındığı fasulyeleri veya baklagilleri yetiştirir.
Amazon'da bulunan tüm bitkilerin gıdayla ilgili özellikleri yoktur. Maun ağaçları, türler tükenmeden önce kesilmiş ve parke mobilya için kullanılmıştır. Annatto bitkisi kırmızı boya yapmak için kullanılan kırmızı bir meyve üretir. Amazon, kauçuk lateks tabanını üreten bitki olan kauçuk ağacının orijinal evidir. Kapok ağacının kabukları içindeki lifler hafif ve kabarıktır ve hem yastıklarda hem de yaşam koruyucularda kullanılır.