Yapay bir ekosistem, doğal bir ekosistemin tüm kriterlerini karşılar ancak insanlar tarafından yapılır ve kontrol edilir. Doğal bir ekosistemi taklit etmek için yaratılmıştır, ancak genellikle daha az karmaşık ve çok düşük bir genetik çeşitliliğe sahiptir. Meyve bahçeleri, tarım arazileri, bahçe ve insan yapımı rezervuarlar yapay ekosistemlerin bazı örnekleridir.
Doğal bir ekosistem, sistemde bulunan canlı olmayan şeylerle önemli ölçüde etkileşime giren çeşitli bitki ve hayvan türlerinden oluşur. Doğal olarak sürdürülebilir ve hayatta kalmak için insanların müdahalesini gerektirmiyor. Bir orman ve bir su birikintisi doğal bir ekosistem örneğidir. Yapay bir ekosistem, ancak insan gözetimi olmadan verimli bir şekilde gelişemez.
Yapay bir ekosistemin her bir bileşenini sürdürülebilir bir çevre haline getirmek için insanların eğilim göstermesi gerekir. Çeltik tarlası, bitki yetiştirmek için gübreler ve tutarlı bir su kaynağı gerektirir. Ekinler hasat edildiğinde, yeni bitkilerin ve organik maddelerin gelişmesi ve gelişmesi için çiftlikten dış kaynaklara bağlı açık bir sistem bırakır. Bir bahçenin yabani otları dışarı çekerek ve parazitleri kimyasal ya da organik gübreler yoluyla yok ederek eğilimi olması gerekir. Küçük kemirgenler, böcekler ve kuşlar da bahçede hayatta kalabilir ve biyoçeşitlilik sağlar, ancak insanlar bahçenin dengesini korumak için bu hayvanların çoğunu uzaklaştırır.