Ormansızlaşma, arazi dönüşümü ve iklim değişikliği yağmur ormanları için en büyük üç risk teşkil eder. Diğer ekosistemler gibi yağmur ormanları da sağlık için özel koşullar gerektirir. Öncelikle kütükleme ve ticari tarım gibi ekonomik teşvikler nedeniyle birçok insan faaliyetinden kaynaklanan tahribat ve kalıcı hasarlar var.
Yağmur ormanları tehditleri arasında ormansızlaşma birçok sorun yaratır. Ormansızlaşma, insan kullanımına yönelik olarak ağaçların kesilmesini ve geniş yağmur ormanları alanlarının temizliğini içerir. Bazı insanlar yağmur ormanlarında ağaçları toplar, inşaat için kullanır ve odun tüketim ürünleri yaratırlar. Kayıt yasal ve yasa dışı olarak gerçekleşir; Sürdürülebilir kütük yağmur ormanlarına büyük tehdit oluşturmazken, yasa dışı kütük kaydı çok zordur. Dünya Vahşi Yaşam Fonu'na göre, Borneo'daki yağmur ormanları yüzde 55'in üzerinde bir toprak kaybıyla karşı karşıya. Birçok gıda maddesinde bulunan palmiye yağına olan küresel talebin artması, ormansızlaşma oranını artırıyor. Arazi kaybı, birçok yerli türü evsiz ve temel kaynaklar olmadan bırakır, sonuçta hayatta kalmalarını tehlikeye atar. Çiftlik arazileri ve hayvancılığın otlatılması ihtiyacı ormansızlaşmaya da katkıda bulunmaktadır.
Orman arazilerini soya ve hurma yağı tesisleri için tarlalara dönüştürmek gibi arazi dönüşümü, çevredeki alanlarda sel ve yangın riskini artırır. Ağaçların sökülmesi ve sökülmesi, ormanların su emme kapasitelerini ortadan kaldırır ve ormanlardaki insan işgali yangınlara yatkın olan daha kuru topraklara yol açar. Son olarak, atmosferdeki daha fazla miktarda karbondioksit ve yükselen deniz seviyelerini içeren iklim değişikliği, yağmur ormanlarının sağlığını tehlikeye atar.