Su molekülleri arasındaki bağa verilen ad bir hidrojen bağıdır. Bu bağlar, bir su molekülünün hafif negatif oksijeni ile başka bir su molekülünün hafif pozitif hidrojeni arasında gerçekleşir. Hidrojen bağı, suya özel fiziksel özellikler verir.
Hidrojen ve oksijen arasındaki elektronegatiflikteki farklılıklar eşit olmayan bir elektron paylaşımına yol açar. Elektronegativite, bir atomun elektronları ne kadar güçlü çekdiğini ölçer. Oksijen, yüksek elektronegatifliği ile paylaşılan elektronları daha fazla çeker ve oksijen atomuna kısmi net negatif yük verir. Paylaşılan elektronlar hidrojen atomları ile daha az zaman harcarlar; bu nedenle, suyun hidrojen bölgeleri kısmi pozitif yüklere sahiptir.
