Protozoa, hücre uzantısı, flagella ve cilia'ya göre hareket eder; hareket yöntemi organizmanın türü ve çevresindeki ortam tarafından belirlenir. Protozoalar üç gruba ayrılır: siliatlar, amipler ve flagellatlar. Kirpikler küçük kirpikler kullanarak hareket eder, flagellates, kürekler ve kürekler olarak flagella kullanarak su içinde hareket eder ve hücrelerinin parçalarını uzatarak yüzeyler boyunca amip gezinir.
Siliatlar en büyük protozoa grubunu oluşturur. Bu organizmalar boyut olarak değişir ve genellikle okyanuslar, bataklıklar, koylar ve akarsular gibi sulu ortamlarda yaşarlar. Bu organizmalar, kirpikler adı verilen, esasen sensörler ve minik uzuvlar gibi davranan küçük saç benzeri teller olan özel yapılar içerir. Kirpiklerin vücutlarını örten birkaç yüz kirpik vardır. Su bazlı siliatlar, sineği, kürek darbelerine benzeyen bir hareketle, ritmik desenlerle çırparak suyun içinde hareket etmek için kullanırlar. Flagellatlar ayrıca öncelikle suda yaşarlar ve uzun kuyruk benzeri flagellalarını suda hareket etmek için kullanırlar. Bu flagellalar, flagella'yı hareket ederken stabilize etmeye yardımcı olarak dümen gibi hareket eder. Siliyerlerin ve flagellatların hareketleri, ayaklar gibi hareket eden esnek hücre zarlarına sahip amiplerden oldukça farklıdır. Amipler, amiplerin çevreleri boyunca hareket etmelerine yardımcı olmak için dışarı doğru çıkıntı yapan bu hücre yapılarını gererek, bükerek ve bükerek yüzeyleri geçerler.
