Endoplazmik retikulumdan Golgi cihazına geçen proteinler, COPII kaplı taşıma araçlarının içinde hareket eder. NCBI web sitesinde Hücrenin Moleküler Biyolojisinin dördüncü sayısına göre, nakliye vezikülleri ER çıkış bölgeleri olarak bilinen endoplazmik retikulum bölgesinden ayrılır. Bu çıkış bölgeleri, aksi halde işlemi geciktirecek, zara bağlı ribozomlara sahip değildir.
Seçilmiş kargo proteinleri, en sonunda konsantre hale geldikleri taşıma keseciklerine doğru çekim yapar. Bilim adamları, bu kargo proteinlerinin, tamamlayıcı reseptör proteinlerini tomurcuklanan vezikül içindeki COPII katının varlığına uyaran bir çıkış sinyaline sahip olduğuna inanmaktadır. Bu, tamamlayıcı proteinlerin vezikül içine hareket etmesine yardımcı olur. Yine de, genellikle ER'de kalan çıkış sinyalleri olmayan bazı proteinler, Golgi aparatına geçmek için tomurcuklanan veziküllerde de paketlenir. Ortalama 50 nanometre taşıma vesikülü içinde, genellikle çeşitli tiplerde yaklaşık 200 membran proteini bulunur.
Ancak, tüm proteinler vezikül gerektirmez. Salgılayıcı proteinler çok yüksek konsantrasyonlarda yapıldığında, bazıları, reseptörleri ayırma yardımı olmadan ER'den sızıntı yapar. Diğer yandan, diğer proteinlerin hiçbir şekilde ayrılmasına izin verilmemektedir. Örneğin, proteinler katlandığında veya yanlış katlandığında, ER içinde bir chaperone proteininde tutulurlar.
